17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3610 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3610  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108072  normal  0.729996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3167  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.3 
 
 		 272 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00456711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2310  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  40 
 
 		 438 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  35.58 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 464 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.38 
 
 		 263 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.44 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.98 
 
 		 329 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  39.19 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  32.97 
 
 		 462 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  39.39 
 
 		 438 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.33 
 
 		 242 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 273 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>