28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2674 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  45.93 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  47.29 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.19 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  42.97 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  48.67 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  42.97 
 
 		 349 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  43.51 
 
 		 355 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  34.81 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  37.04 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  34.07 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  37.8 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  37.01 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  33.08 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.84 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  37.78 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  34.51 
 
 		 356 aa  77.4  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.65 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  29.01 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  27.56 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  30.58 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  29.75 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0536  hypothetical protein  25.74 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.368426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>