36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1805 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  100 
 
 		 474 aa  988    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  54.76 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  53.88 
 
 		 460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  51.61 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  44.01 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  27.84 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  28.7 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  28.01 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  31.53 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  28.39 
 
 		 475 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  28.79 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  27.41 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  28.66 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  27.95 
 
 		 483 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  30.92 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  28.3 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  26.06 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  32.28 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  21.07 
 
 		 476 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  22.34 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.64 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  27.38 
 
 		 496 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  24.64 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  22.01 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  24.4 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  22.12 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  20.83 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  22.95 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  21.11 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  23.18 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  23.18 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  23.53 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  23.53 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  24.81 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  24.04 
 
 		 467 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  25 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>