20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0569 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  27.57 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  26.87 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  25.27 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  27.1 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  25.82 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  23.86 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  24.31 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  22.07 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  21.54 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  22.37 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  23.18 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  31.75 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  27.23 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  27.83 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3239  hypothetical protein  23.34 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  22.77 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3746  hypothetical protein  20.08 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00354486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  23.92 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>