More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 469 aa  939    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1592  monooxygenase  68.18 
 
 		 521 aa  591  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.147927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4352  monooxygenase  67.03 
 
 		 471 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3486  putative oxygenase  64.4 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3877  monooxygenase  64.16 
 
 		 441 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1983  fmnh2-utilizing oxygenase  64.49 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2017  putative FMNH2-utilizing oxygenase  63.9 
 
 		 455 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0632006  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3795  FMNH2-utilizing oxygenase  62.44 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6191  monooxygenase  60.91 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0618693  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7210  monooxygenase  53.39 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0931  putative nitrilotriacetate monoxygenase, component A  49.66 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.027595  normal  0.0155722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0294  putative monooxygenase  49.67 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3704  putative monooxygenase  48.31 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3904  putative oxygenase  46.62 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02230  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.17 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  40.58 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.56 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.61 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  41.89 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  42.76 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.74 
 
 		 457 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  43.68 
 
 		 444 aa  302  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  43.11 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  41.59 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.19 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  39.29 
 
 		 453 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  39.87 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.56 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.47 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.4 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.44 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.82 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  39.87 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  40.22 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  40.98 
 
 		 445 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.46 
 
 		 451 aa  292  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  40.72 
 
 		 449 aa  292  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  39.6 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.43 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.56 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  39.25 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  44.39 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.69 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  40.85 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  39.47 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.02 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.21 
 
 		 446 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  38.72 
 
 		 451 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  39.7 
 
 		 492 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.94 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.56 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.29 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  40.43 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  40.45 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  39.65 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  40.4 
 
 		 449 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  39.65 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  40.04 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.09 
 
 		 452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  39.24 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.34 
 
 		 468 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.34 
 
 		 495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.34 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  39.2 
 
 		 1121 aa  283  6.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.89 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  38.73 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  39.46 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  39.06 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  39.64 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  38.62 
 
 		 442 aa  279  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  38.31 
 
 		 438 aa  279  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  40.94 
 
 		 461 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  38.79 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  39.78 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.77 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  37.66 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.78 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.11 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  39.47 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.25 
 
 		 448 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  40 
 
 		 442 aa  276  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  40.58 
 
 		 451 aa  276  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  37.72 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  36.62 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  39.69 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  38.95 
 
 		 474 aa  273  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  39.02 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  39.55 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  38.75 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  38.75 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  38.75 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  37.5 
 
 		 450 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  38.75 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  38.75 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  38.75 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  37.25 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  37.47 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.57 
 
 		 445 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  38.8 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  39.29 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>