43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  54.31 
 
 		 321 aa  218  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  59.33 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  54.26 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  40.53 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  57.52 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  54.59 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  51.27 
 
 		 179 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  51.11 
 
 		 167 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  45.86 
 
 		 340 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  47.65 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  47.65 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  47.65 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  49.32 
 
 		 175 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  48.63 
 
 		 175 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  54.25 
 
 		 169 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  47.47 
 
 		 173 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  47.06 
 
 		 172 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  48.67 
 
 		 170 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  47.22 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  42.08 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  43.57 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  47.26 
 
 		 162 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  48.53 
 
 		 170 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  48.28 
 
 		 169 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  39.62 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  38.38 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  35.46 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  44.85 
 
 		 160 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  50.39 
 
 		 157 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  40.79 
 
 		 154 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  44.03 
 
 		 185 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  40.76 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  41.96 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  39.57 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  36.76 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  36.21 
 
 		 568 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.07 
 
 		 1888 aa  43.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  31.33 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>