66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  100 
 
 		 585 aa  1141    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  45.92 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  44.79 
 
 		 523 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  47.21 
 
 		 552 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  42.3 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  39.15 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  39.65 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  36.99 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  37.68 
 
 		 518 aa  360  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  39.24 
 
 		 538 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  39.31 
 
 		 535 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  38.61 
 
 		 538 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  39.03 
 
 		 534 aa  347  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  38.93 
 
 		 539 aa  346  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  39.53 
 
 		 535 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  39.71 
 
 		 535 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  39.53 
 
 		 535 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  37.19 
 
 		 512 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  37.17 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  33.99 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  38.84 
 
 		 537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  40.39 
 
 		 525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  37.44 
 
 		 540 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  38.75 
 
 		 539 aa  339  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  34.35 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  37.26 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  37.26 
 
 		 540 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  34.22 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  39.29 
 
 		 511 aa  335  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  33.27 
 
 		 519 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  37.66 
 
 		 519 aa  333  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  37.32 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  38.41 
 
 		 528 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.12 
 
 		 507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  37.72 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  37.17 
 
 		 530 aa  327  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  38.58 
 
 		 534 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  35.38 
 
 		 519 aa  323  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  38.76 
 
 		 522 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  34.06 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.06 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  34.06 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.06 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  34.06 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.06 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.06 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  35.66 
 
 		 529 aa  319  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.06 
 
 		 510 aa  319  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.39 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  34.85 
 
 		 519 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  35.39 
 
 		 519 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  35.39 
 
 		 519 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  34.27 
 
 		 519 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.48 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  34.45 
 
 		 511 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  34.89 
 
 		 506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  31 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  31 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  30.07 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  29.76 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  33.21 
 
 		 518 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  32.85 
 
 		 518 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  31.53 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  37.69 
 
 		 263 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  48.15 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1855  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter-like protein  45.45 
 
 		 88 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>