45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07970  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  100 
 
 		 291 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131897  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2708  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  68.5 
 
 		 179 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.826826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2611  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.61 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.132011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26850  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  50 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.405147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2545  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.24 
 
 		 137 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2514  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.59 
 
 		 149 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0106  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  48.33 
 
 		 209 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6027  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.46 
 
 		 191 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.350512 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0104  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.49 
 
 		 196 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1423  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.57 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0352  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  44.54 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5359  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.52 
 
 		 175 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0342  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  44.54 
 
 		 190 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1418  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.09 
 
 		 195 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0331  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  43.7 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2177  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.94 
 
 		 207 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148812  normal  0.0743485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4520  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  43.8 
 
 		 190 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2293  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.5 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2154  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.18 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119345  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.59 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4603  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.37 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.336858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4989  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.37 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4961  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.43 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5008  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.43 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5104  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.43 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4743  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.43 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.17 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.51 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4581  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.45 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.03 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0259  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.43 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0170483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.03 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.03 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4758  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.62 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.03 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.03 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.23 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4978  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.43 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  21.63 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.46 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2914  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.95 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  0.295776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.53 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17500  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.78 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.050833  normal  0.192167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>