37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1891 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2031  response regulator receiver protein  58.08 
 
 		 620 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2033  hypothetical protein  57.76 
 
 		 620 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461575  hitchhiker  0.0000553349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2430  response regulator receiver protein  57.67 
 
 		 619 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2314  response regulator receiver protein  57.67 
 
 		 619 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2437  hypothetical protein  68.04 
 
 		 631 aa  833    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1946  response regulator receiver protein  90.25 
 
 		 646 aa  1139    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2087  hypothetical protein  97.48 
 
 		 635 aa  1202    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1291    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.724529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1931  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  54.26 
 
 		 583 aa  601  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2582  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0740866  hitchhiker  0.000257822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2023  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 582 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2373  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  36.13 
 
 		 580 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2086  hypothetical protein  36.69 
 
 		 591 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.869328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2191  hypothetical protein  35.57 
 
 		 600 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000298084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1894  hypothetical protein  34.53 
 
 		 583 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.910891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1850  hypothetical protein  29.74 
 
 		 554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.19 
 
 		 711 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.46 
 
 		 716 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.46 
 
 		 714 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.46 
 
 		 714 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.46 
 
 		 714 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.46 
 
 		 714 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.92 
 
 		 715 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.92 
 
 		 715 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.92 
 
 		 715 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  32.11 
 
 		 716 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.33 
 
 		 716 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.47 
 
 		 716 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.58 
 
 		 716 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.33 
 
 		 716 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.87 
 
 		 716 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  28.87 
 
 		 716 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  32.46 
 
 		 717 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.38 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  32.46 
 
 		 716 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.92 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.5 
 
 		 718 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>