33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1888 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2439  srpA-related protein  53.75 
 
 		 716 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1888  SrpA-related protein  100 
 
 		 717 aa  1429    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2090  SrpA-related protein  94.42 
 
 		 717 aa  1312    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1943  protein-glutamate O-methyltransferase  83.38 
 
 		 740 aa  1122    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.63049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1929  SrpA-related protein  41.24 
 
 		 598 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2432  protein-glutamate O-methyltransferase  44.77 
 
 		 807 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2316  protein-glutamate O-methyltransferase  42.43 
 
 		 814 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2031  SrpA-related protein  53.6 
 
 		 816 aa  300  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142674  hitchhiker  0.000763047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2029  protein-glutamate O-methyltransferase  48.1 
 
 		 833 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2585  SrpA-related protein  48.8 
 
 		 435 aa  197  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611843  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1777  SrpA-related protein  52.86 
 
 		 467 aa  192  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2089  SrpA-related protein  47.23 
 
 		 465 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.885668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2020  SrpA-related protein  43.32 
 
 		 479 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.511866  normal  0.928419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2194  hypothetical protein  60.74 
 
 		 427 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1853  hypothetical protein  37.83 
 
 		 594 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4228  hypothetical protein  58.72 
 
 		 333 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03991  hypothetical protein  55.56 
 
 		 327 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2751  hypothetical protein  49.25 
 
 		 238 aa  119  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00712374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4082  hypothetical protein  55.67 
 
 		 244 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0096  hypothetical protein  56.07 
 
 		 236 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3133  hypothetical protein  45.97 
 
 		 300 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0215  hypothetical protein  50.88 
 
 		 346 aa  99  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0608  hypothetical protein  40.79 
 
 		 273 aa  98.6  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.195723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1783  hypothetical protein  45.71 
 
 		 249 aa  91.7  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0518  hypothetical protein  49.49 
 
 		 296 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2219  hypothetical protein  43.1 
 
 		 210 aa  85.5  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0031  hypothetical protein  42.61 
 
 		 138 aa  85.1  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0738  hypothetical protein  41.59 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00987053  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1787  hypothetical protein  40.8 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0135  hypothetical protein  39.01 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1538  hypothetical protein  49.02 
 
 		 234 aa  54.7  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0441  hypothetical protein  50 
 
 		 241 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.947365  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0467  hypothetical protein  50 
 
 		 234 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>