19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0573 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  91.1 
 
 
337 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  91.69 
 
 
337 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  86.32 
 
 
298 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  72.64 
 
 
298 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  82.44 
 
 
300 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  82.44 
 
 
298 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  83.01 
 
 
298 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  80.43 
 
 
294 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  45.82 
 
 
293 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  45.88 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  45.86 
 
 
303 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  44.11 
 
 
294 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  42.59 
 
 
292 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  44.12 
 
 
312 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  42.44 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  28.64 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  24.92 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03701  hypothetical protein  25.9 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>