20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2143 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2143  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  470  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000288858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2677  hypothetical protein  67.14 
 
 		 221 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0618791  normal  0.239313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1945  hypothetical protein  61.03 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000111939  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2632  hypothetical protein  60.19 
 
 		 213 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000426447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2593  hypothetical protein  61.03 
 
 		 213 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1753  hypothetical protein  60.19 
 
 		 213 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000904353  hitchhiker  0.0017459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2318  hypothetical protein  58.37 
 
 		 212 aa  278  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2707  hypothetical protein  59.72 
 
 		 213 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1990  hypothetical protein  57.35 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2343  hypothetical protein  56.94 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2271  hypothetical protein  56.94 
 
 		 213 aa  264  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1902  hypothetical protein  56.8 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000136696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2315  hypothetical protein  55.45 
 
 		 219 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2461  hypothetical protein  55.5 
 
 		 213 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2143  hypothetical protein  54.72 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000268028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2031  hypothetical protein  48.6 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000129168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1052  hypothetical protein  40.95 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1591  hypothetical protein  37.77 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0202713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2931  hypothetical protein  36.59 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>