56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0259 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  276  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  71.32 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  75.4 
 
 		 127 aa  191  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  73.77 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  70.4 
 
 		 130 aa  183  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  71.31 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  66.93 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  65.12 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  65.12 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  64.34 
 
 		 132 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  63.78 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  65.12 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  64.34 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  64.34 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  62.99 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  64.34 
 
 		 133 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  57.69 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1895  hypothetical protein  40.29 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  43.27 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  45.83 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1958  hypothetical protein  43.36 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2188  hypothetical protein  37.98 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  43 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3209  hypothetical protein  41.82 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2858  hypothetical protein  40.17 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02547  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.950234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3145  hypothetical protein  43.24 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0957  conserved hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3020  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2869  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02582  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0980  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3984  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2982  hypothetical protein  39.62 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3065  hypothetical protein  39.62 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286302  normal  0.0781246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3049  hypothetical protein  37.17 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3013  hypothetical protein  37.17 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0169522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3170  hypothetical protein  37.17 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.740312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  39.82 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1421  hypothetical protein  42.16 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0950425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2046  hypothetical protein  46.46 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00536411  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  37.25 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1046  hypothetical protein  39.58 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0209  hypothetical protein  34.69 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  25.89 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  36.17 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  36.17 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  26.27 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3248  hypothetical protein  31.63 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  39.29 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>