20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1878 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  35.92 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  38.22 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  38.43 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  38.17 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  36.28 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  30.21 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  29.33 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  31.88 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  31.28 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  31.28 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  31.28 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  30.84 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4554  hypothetical protein  26.49 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>