55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1532 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  333  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  333  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  333  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 166 aa  333  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  93.37 
 
 		 166 aa  317  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  92.77 
 
 		 166 aa  317  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  92.17 
 
 		 166 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  92.17 
 
 		 166 aa  314  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  91.57 
 
 		 166 aa  313  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  79.52 
 
 		 168 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  75.15 
 
 		 166 aa  255  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  74.7 
 
 		 168 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.7 
 
 		 166 aa  237  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.68 
 
 		 164 aa  233  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.52 
 
 		 165 aa  228  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.48 
 
 		 166 aa  217  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.73 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  34.55 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  33.14 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  34.55 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  31.76 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  32.73 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  33.72 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  33.54 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  33.54 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.97 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  28.22 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  26.99 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.1 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.85 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  34.51 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  31.68 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  31.52 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  25.16 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  26.95 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  29.49 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.59 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  27.27 
 
 		 385 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.11 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  21.69 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  25 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  26.25 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  24.82 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  22.93 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  22.64 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.82 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.98 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  21.38 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  25.43 
 
 		 179 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  22.9 
 
 		 1319 aa  41.2  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  26.15 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>