15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  100 
 
 		 957 aa  1961    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  32.62 
 
 		 933 aa  445  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  22.66 
 
 		 892 aa  160  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  22.61 
 
 		 888 aa  141  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  21.55 
 
 		 894 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  20.93 
 
 		 962 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  21.37 
 
 		 903 aa  77.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1829  glycosyltransferase  21.85 
 
 		 937 aa  65.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  20.9 
 
 		 883 aa  59.7  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  27.56 
 
 		 1140 aa  55.5  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  43.94 
 
 		 1045 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  37.93 
 
 		 623 aa  48.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  25 
 
 		 880 aa  47.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  30.14 
 
 		 859 aa  46.6  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  36.11 
 
 		 822 aa  44.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>