22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06670 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  141  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  47.73 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  35.59 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  47.62 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  44.19 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  48.89 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  33.82 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  47.37 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  39.53 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  36.54 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  42.5 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  52.78 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  38.1 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  47.5 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  42.11 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  38.1 
 
 		 75 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>