35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05300  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  523  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0713  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  21.77 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.702118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3963  hypothetical protein  31.19 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0050  hypothetical protein  21.63 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 294 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  23.69 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  26.72 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  26.72 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1572  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  27.78 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 330 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 288 aa  45.4  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.37 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  28.12 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  28.12 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.12 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.37 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  30.21 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  27.42 
 
 		 322 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 300 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  21.28 
 
 		 243 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 321 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>