36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04560  protein of unknown function, DUF285  100 
 
 		 283 aa  587  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.593909  hitchhiker  0.000000409954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  25.66 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  25.85 
 
 		 2670 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  22.75 
 
 		 789 aa  58.9  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  29.48 
 
 		 2415 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.75 
 
 		 1227 aa  55.8  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  21.55 
 
 		 451 aa  54.7  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  22.75 
 
 		 741 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  20.93 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  23.67 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  22.49 
 
 		 486 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  22.86 
 
 		 857 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  24.14 
 
 		 933 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  19.88 
 
 		 754 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  22.12 
 
 		 634 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  24.16 
 
 		 862 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.77 
 
 		 800 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  21.95 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 414 aa  47  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  24.05 
 
 		 399 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  24.84 
 
 		 907 aa  46.2  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  19.33 
 
 		 809 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  23.03 
 
 		 762 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  30.56 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  23.4 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  25 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  24.59 
 
 		 862 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  23.65 
 
 		 452 aa  43.9  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  24.18 
 
 		 405 aa  43.5  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  24.49 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  23.18 
 
 		 427 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  20.73 
 
 		 609 aa  42.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  21.64 
 
 		 200 aa  42.4  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  24.54 
 
 		 1038 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>