221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01040  acyl carrier protein  100 
 
 		 74 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.218894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26769  predicted protein  52.08 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.973037  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0345  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0352923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  48.15 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  36.49 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  49.21 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  46.55 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  40.58 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0430  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000189209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  36 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  38.46 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  40.98 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  39.19 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  45.61 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  40.98 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  45.61 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  45 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  42.65 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  37.68 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04530  phosphopantetheine-containing protein  31.51 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.832197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  43.86 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  34.21 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  47.17 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1990  phosphopantetheine-binding  36.11 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.596379  normal  0.457201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23640  phosphopantetheine-containing protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.309349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  40 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1587  acyl carrier protein  50.91 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1644  acyl carrier protein  50.91 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.28963  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  43.33 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  43.86 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  41.27 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  32.88 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  45.16 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  43.55 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  36.99 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  43.86 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  38.96 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>