20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3730 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3730  glutaconate CoA-transferase subunit B  100 
 
 		 71 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  42.86 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  39.44 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  40 
 
 		 260 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  46.67 
 
 		 256 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  37.14 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  33.8 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  32.86 
 
 		 273 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  38.46 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  36.67 
 
 		 258 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  33.85 
 
 		 243 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  34.72 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  39.06 
 
 		 247 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  32.31 
 
 		 243 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  31.43 
 
 		 275 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  32.31 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  44.74 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  29.41 
 
 		 271 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  30 
 
 		 274 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  30 
 
 		 274 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>