30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3289 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  100 
 
 		 439 aa  887    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  29.66 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  30.3 
 
 		 291 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  30.3 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  30.3 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  26.9 
 
 		 317 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  33.04 
 
 		 121 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.45 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.83 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.79 
 
 		 255 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  34.45 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  32.32 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 		 268 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.93 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.73 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  23.62 
 
 		 312 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  23.33 
 
 		 307 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.78 
 
 		 315 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  24.34 
 
 		 312 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  26.53 
 
 		 255 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  29.93 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>