237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3885 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3885  phosphate transporter  100 
 
 		 347 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0370  phosphate transporter  81.27 
 
 		 347 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205571  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0010  phosphate transporter  42.17 
 
 		 309 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0010  phosphate transporter  41.87 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0789  phosphate transporter  35.99 
 
 		 308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0286  phosphate transporter  34.42 
 
 		 310 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.612089  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0884  phosphate transporter  34.16 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0726  phosphate transporter  30.56 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000419636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  28.45 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0151  phosphate transporter  26.91 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0872  phosphate transporter  28.39 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.152415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0037  phosphate transporter  22.15 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  37.13 
 
 		 429 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  24.75 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  36.48 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  23.54 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  25.12 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  30.14 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  32.89 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  31.52 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  30 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  31.45 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  31.52 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  32.1 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  31.52 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  29.55 
 
 		 431 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  30.46 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  32.08 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  32.05 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  31.85 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  33.15 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  29.94 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  29.56 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  26.72 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  34.48 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  31.65 
 
 		 422 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_32  phosphate/sulfate transporter, PiT family  28.61 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  31.71 
 
 		 599 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  33.77 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  29.11 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  29.87 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0034  phosphate transporter  28.57 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.81002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  26.24 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  32.47 
 
 		 535 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  32.7 
 
 		 497 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  29.56 
 
 		 521 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1653  phosphate transporter  27.4 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.217957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  33.55 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  24.72 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  23.54 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  27.65 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  25.59 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  23.1 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0031  phosphate transporter  28.06 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.952576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  25.81 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  31.65 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  25.55 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  23.89 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  31.13 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  24.5 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  26.47 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  26.47 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  24.5 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0277  phosphate transporter  25.44 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  31.36 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  25.88 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  24.64 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  25.88 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  30.98 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  25.08 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  24.78 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  25.29 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  25.29 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  23.72 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  25.29 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  25.29 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  29.57 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  24.92 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  22.36 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  24.61 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  28.31 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  27.67 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  31.37 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  25.55 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  28.25 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  24.18 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  27.71 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  25.15 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  29.38 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  25.27 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  27.12 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  24.01 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  28.49 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10343  phosphate-repressible Na+/phosphate cotransporter Pho89, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03010)  27.1 
 
 		 580 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0889794  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  32.4 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  28.32 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  26.95 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  24.61 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  24.01 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  21.88 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>