17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2276 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2276  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  141  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3609  hypothetical protein  62.12 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.1 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.66 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.66 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.86 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.08 
 
 		 96 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  41.51 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>