29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0379 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0379  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4198  hypothetical protein  73.68 
 
 		 61 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3694  hypothetical protein  71.93 
 
 		 61 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0251  hypothetical protein  71.93 
 
 		 61 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3999  hypothetical protein  73.68 
 
 		 61 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4109  hypothetical protein  73.68 
 
 		 61 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4080  hypothetical protein  73.68 
 
 		 61 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3890  hypothetical protein  71.93 
 
 		 61 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0290  hypothetical protein  70.18 
 
 		 62 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  71.93 
 
 		 61 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3702  hypothetical protein  70.18 
 
 		 61 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  69.64 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  70.59 
 
 		 53 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0217  hypothetical protein  66.67 
 
 		 57 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0439788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3364  hypothetical protein  56.36 
 
 		 60 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0265  hypothetical protein  64.91 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.055242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1527  hypothetical protein  41.38 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.582526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2012  hypothetical protein  42.59 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000726923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1524  hypothetical protein  43.1 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000098396  normal  0.105023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0554  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00506  hypothetical protein  37.04 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0476  hypothetical protein  44.23 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3109  hypothetical protein  36.21 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3454  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40740  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2150  hypothetical protein  32.2 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382415  normal  0.246071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1452  hypothetical protein  29.09 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.965141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0662  hypothetical protein  48.48 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27500  hypothetical protein  34.48 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>