21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1452 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1452  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.965141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0753  hypothetical protein  53.45 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.0231659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  40.35 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  38.89 
 
 		 74 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  41.51 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0923  hypothetical protein  40.98 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4516  hypothetical protein  41.38 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  31.58 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  37.74 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0217  hypothetical protein  35.71 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0439788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0379  hypothetical protein  29.09 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2815  hypothetical protein  38.18 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00688356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3178  hypothetical protein  34.21 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00832421  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  34.04 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1248  hypothetical protein  32.73 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1242  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0627  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1436  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1467  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0526  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>