21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4516 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4516  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0923  hypothetical protein  80.65 
 
 
62 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3580  hypothetical protein  70.97 
 
 
62 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.736223 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0526  hypothetical protein  59.68 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1467  hypothetical protein  59.68 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1242  hypothetical protein  59.68 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0627  hypothetical protein  59.68 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1436  hypothetical protein  59.68 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2815  hypothetical protein  62.07 
 
 
76 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00688356  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5419  hypothetical protein  47.46 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0471982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3575  hypothetical protein  47.46 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0755939  normal  0.017999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5038  hypothetical protein  47.46 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3849  hypothetical protein  45.76 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3672  hypothetical protein  45.76 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4691  hypothetical protein  45.76 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2437  hypothetical protein  42.37 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0753  hypothetical protein  51.67 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.0231659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1452  hypothetical protein  41.38 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.965141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  39.34 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  40.74 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  44.68 
 
 
70 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>