16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3575 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5419  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0471982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3575  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0755939  normal  0.017999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5038  hypothetical protein  95.52 
 
 
67 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2437  hypothetical protein  92.54 
 
 
67 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237407  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4691  hypothetical protein  89.55 
 
 
84 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3672  hypothetical protein  89.55 
 
 
84 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3849  hypothetical protein  89.55 
 
 
67 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4516  hypothetical protein  47.46 
 
 
62 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0923  hypothetical protein  44.83 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3580  hypothetical protein  46.55 
 
 
62 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.736223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1242  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0627  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1436  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1467  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0526  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2815  hypothetical protein  44.44 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00688356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>