10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0076 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0076  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.941243 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  72.88 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0009  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  70.76 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000759662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0030  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  71.19 
 
 		 248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0272  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  70.34 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  34.57 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  33.92 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  38.89 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  40 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05830  TraX domain-containing membrane protein  36.92 
 
 		 246 aa  42  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>