50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4924 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  99.22 
 
 		 954 bp  1469    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  99.51 
 
 		 513 bp  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4924    100 
 
 		 765 bp  1516    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.497677  normal  0.614966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  99.22 
 
 		 954 bp  1469    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  97.55 
 
 		 966 bp  1403    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  81.07 
 
 		 927 bp  153  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  80.76 
 
 		 915 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  80.76 
 
 		 915 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  80.18 
 
 		 915 bp  139  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  80.44 
 
 		 915 bp  137  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  82.1 
 
 		 930 bp  129  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  82.1 
 
 		 942 bp  129  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  81.66 
 
 		 942 bp  121  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  81.66 
 
 		 930 bp  121  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  81.66 
 
 		 942 bp  121  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  80 
 
 		 903 bp  73.8  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  89.83 
 
 		 879 bp  69.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  79.46 
 
 		 891 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  79.46 
 
 		 891 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  79.46 
 
 		 891 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    79.46 
 
 		 1668 bp  65.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  79.46 
 
 		 891 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  79.46 
 
 		 891 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  83.72 
 
 		 879 bp  60  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  83.72 
 
 		 879 bp  60  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2455    78.92 
 
 		 891 bp  58  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00648259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3657    91.11 
 
 		 921 bp  58  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  91.11 
 
 		 768 bp  58  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  91.11 
 
 		 309 bp  58  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  83.75 
 
 		 879 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  83.75 
 
 		 879 bp  56  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  86.44 
 
 		 879 bp  54  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  86.44 
 
 		 879 bp  54  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  86.44 
 
 		 879 bp  54  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  86.44 
 
 		 879 bp  54  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5853    92.31 
 
 		 783 bp  54  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.510019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  78.49 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  96.55 
 
 		 897 bp  50.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  93.94 
 
 		 933 bp  50.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  96.55 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  96.55 
 
 		 903 bp  50.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  96.55 
 
 		 903 bp  50.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  96.55 
 
 		 927 bp  50.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  96.55 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  96.55 
 
 		 903 bp  50.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  96.55 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  96.55 
 
 		 903 bp  50.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  96.55 
 
 		 903 bp  50.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  81.82 
 
 		 933 bp  48.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  90 
 
 		 960 bp  48.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>