26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3325 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3325  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0234254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3145  hypothetical protein  99.47 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3211  hypothetical protein  98.93 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0227647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3225  hypothetical protein  99.43 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0159896 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3162  hypothetical protein  98.28 
 
 		 174 aa  360  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.371591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3145  hypothetical protein  67.38 
 
 		 187 aa  284  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0305853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02634  hypothetical protein  67.38 
 
 		 187 aa  283  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02673  hypothetical protein  67.38 
 
 		 187 aa  283  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.315688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2972  hypothetical protein  67.38 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157774  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0866  prepilin peptidase dependent protein B  67.38 
 
 		 187 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2971  hypothetical protein  67.38 
 
 		 187 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0890  hypothetical protein  67.38 
 
 		 187 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3037  hypothetical protein  66.84 
 
 		 187 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4090  hypothetical protein  66.84 
 
 		 187 aa  279  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171812  normal  0.628463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3267  hypothetical protein  54.79 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  35.11 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  35.11 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  35.11 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3819  putative prepilin peptidase dependent protein  34.57 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21629  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  31.98 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  33.55 
 
 		 203 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  34.59 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3193  hypothetical protein  32.28 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  25.13 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  22.56 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  30.13 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>