31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3046 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  100 
 
 		 154 aa  320  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  99.35 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2773  head completion protein  99.35 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.572035  decreased coverage  0.0000162418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  98.05 
 
 		 175 aa  314  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3175  head completion protein  52.08 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  49.68 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  49.38 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  49.38 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  46.9 
 
 		 163 aa  136  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3293  phage head completion  44.16 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3497  phage head completion  45 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4369  phage head completion protein  42.47 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  hitchhiker  0.00000000450076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4327  phage head completion protein GPL  41.72 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3048  phage head completion protein GPL  41.72 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  44.29 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01359  phage head completion protein (GPL)  40.79 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0304112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  41.45 
 
 		 159 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1348  fels-2 prophage protein  44.6 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  42.25 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3829  head completion protein  34.57 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2645  head completion protein  38.57 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00983423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  36.17 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  27.78 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  29.73 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  30.72 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  27.27 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  30.72 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  27.21 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  27.34 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1468  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  28.12 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2763  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  28.12 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.749387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>