49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2779 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  99.29 
 
 
567 aa  1161    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  98.94 
 
 
567 aa  1157    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  62.37 
 
 
551 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  100 
 
 
567 aa  1169    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  54.67 
 
 
565 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  35.74 
 
 
543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  38.32 
 
 
541 aa  349  9e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  40.37 
 
 
323 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  40.06 
 
 
323 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  31.27 
 
 
364 aa  183  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  33.62 
 
 
359 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  33.33 
 
 
359 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  33.23 
 
 
321 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  37.18 
 
 
360 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1304  hypothetical protein  32.88 
 
 
230 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0742  hypothetical protein  33.92 
 
 
229 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.10229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1447  hypothetical protein  34.07 
 
 
228 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129718  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2744  hypothetical protein  34.07 
 
 
228 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.950913  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05048  hypothetical protein  29.78 
 
 
229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5075  hypothetical protein  34.21 
 
 
230 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0721  hypothetical protein  31.28 
 
 
225 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0681  hypothetical protein  33.19 
 
 
232 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0262  hypothetical protein  32.16 
 
 
233 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  46.15 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  38.46 
 
 
231 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0565  hypothetical protein  28.14 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.465028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  48.81 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  32.09 
 
 
197 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  27.5 
 
 
250 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  25.67 
 
 
641 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  24.02 
 
 
240 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  26.84 
 
 
646 aa  51.2  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  26.43 
 
 
668 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  26.43 
 
 
668 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  24.68 
 
 
780 aa  50.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  23.13 
 
 
656 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  25.65 
 
 
669 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  24.59 
 
 
794 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  23.33 
 
 
655 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  51.92 
 
 
58 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  23.23 
 
 
771 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  26.46 
 
 
642 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  30 
 
 
241 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  27.04 
 
 
683 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  24.26 
 
 
602 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  19.85 
 
 
683 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  24.37 
 
 
680 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.25 
 
 
668 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>