84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1628 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1628  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.325697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0711  thioredoxin domain-containing protein  50.54 
 
 
198 aa  201  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0694  hypothetical protein  44.85 
 
 
199 aa  179  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1249  thioredoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
200 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1061  possible periplasmic thioredoxin  46.24 
 
 
205 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1124  thioredoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
200 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0059  thioredoxin domain-containing protein  44.56 
 
 
198 aa  167  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.457756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0616  thioredoxin domain-containing protein  40.91 
 
 
200 aa  167  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.28635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1112  thioredoxin domain-containing protein  40.5 
 
 
197 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0844  putative lipoprotein thiredoxin  26.83 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  29.35 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.03 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.85 
 
 
196 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  29.73 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  27.14 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
280 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.34 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0209  periplasmic protein thiol  24.65 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0534506 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  25.35 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  33.68 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.44 
 
 
409 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  24.65 
 
 
185 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  24.65 
 
 
185 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0110  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  33.33 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.346566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  26.36 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  27.12 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  23.81 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  38.3 
 
 
155 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1210  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  27.56 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  25.42 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.26 
 
 
187 aa  45.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
377 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  27.03 
 
 
183 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.92 
 
 
182 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1288  thiol:disulfide interchange protein CycY  35.56 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.1 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.75 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  27.78 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.2 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  30.19 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1512  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  23.14 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  22.95 
 
 
437 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2528  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.95 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  23.08 
 
 
279 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  22.22 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  24.68 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1208  periplasmic protein thiol  25.62 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  29.23 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  21.71 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0096  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  34.09 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  26.32 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0098  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  34.09 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  25.52 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.63 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  24.71 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  21.43 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  26.09 
 
 
173 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  26.44 
 
 
162 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  21.71 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03068  thiol:disulfide interchange protein dsbE (cytochrome c biogenesis protein ccmG)  27.1 
 
 
219 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.375687  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.85 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  26.92 
 
 
182 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.31 
 
 
191 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3362  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.78 
 
 
192 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
195 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1550  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.39 
 
 
176 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.277857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  28.38 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  45.71 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2391  periplasmic protein thiol  28.16 
 
 
174 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000209434  hitchhiker  0.0000195548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.74 
 
 
194 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.85 
 
 
183 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  24.6 
 
 
174 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.43 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
175 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.47 
 
 
342 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.33 
 
 
191 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.82 
 
 
183 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  31.34 
 
 
187 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  29.23 
 
 
193 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.19 
 
 
191 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>