47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0260 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  239  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0132  hypothetical protein  48.28 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  42.98 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1018  hypothetical protein  29.57 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  31.07 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  35.51 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  31.07 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  31.07 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  30.1 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  29.13 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  29.13 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  41.79 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  29.13 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  30.1 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  29.41 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  29.13 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  32.67 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  45.61 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3248  hypothetical protein  27.55 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  32.67 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  45.61 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  31.37 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  29.13 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  29.13 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  30.1 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  30.39 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  25.49 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  29.52 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  30.3 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  39.29 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1046  hypothetical protein  41.07 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  30.63 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  28.04 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2869  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02582  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0957  conserved hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02547  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.950234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3145  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0980  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3020  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3984  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2982  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3065  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286302  normal  0.0781246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  25 
 
 		 114 aa  40  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>