16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2753 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  100 
 
 
775 aa  1573    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1324  PglZ domain protein  47.04 
 
 
777 aa  717    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0766766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1135  PglZ domain protein  52.7 
 
 
786 aa  833    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  43 
 
 
784 aa  632  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3232  hypothetical protein  39.07 
 
 
785 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1711  hypothetical protein  40.76 
 
 
679 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  40.62 
 
 
679 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  34.46 
 
 
769 aa  435  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  22 
 
 
841 aa  75.1  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  24 
 
 
732 aa  67.8  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  26.44 
 
 
746 aa  66.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  24.14 
 
 
730 aa  58.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  22.89 
 
 
953 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  26.8 
 
 
1016 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  26.8 
 
 
1016 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  25.31 
 
 
856 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>