More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1231 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  69.04 
 
 		 518 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  67.31 
 
 		 509 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  65.64 
 
 		 519 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  67.5 
 
 		 519 aa  683    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  67.5 
 
 		 519 aa  683    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000026912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  65.83 
 
 		 515 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  66.16 
 
 		 520 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  67.5 
 
 		 519 aa  686    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  67.69 
 
 		 518 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 521 aa  1036    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  68.27 
 
 		 519 aa  702    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  67.5 
 
 		 519 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  66.73 
 
 		 504 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  66.15 
 
 		 521 aa  674    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  73.83 
 
 		 521 aa  744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  67.5 
 
 		 519 aa  686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2406  sulphate transporter  67.69 
 
 		 525 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2476  sulphate transporter  67.5 
 
 		 525 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  72.88 
 
 		 521 aa  752    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  67.5 
 
 		 519 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  64.38 
 
 		 540 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2568  sulphate transporter  68.46 
 
 		 519 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.612653  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2635  sulphate transporter  68.08 
 
 		 518 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000740978  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  57.78 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  58.79 
 
 		 541 aa  589  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  59.3 
 
 		 540 aa  587  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  58.12 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2067  sulfate transporter  61.3 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  54.47 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  56.38 
 
 		 539 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  55.81 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  55.73 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  56.57 
 
 		 539 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  54.42 
 
 		 509 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  57.23 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  55.78 
 
 		 504 aa  542  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  52.23 
 
 		 511 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  56.16 
 
 		 509 aa  531  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  55.15 
 
 		 525 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2321  sulphate transporter  59.1 
 
 		 536 aa  522  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  50 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  51.53 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  53.06 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  53.66 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  52.24 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  47.1 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  52.33 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1752  sulphate transporter  52.33 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.516323  normal  0.0556997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  51.32 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41950  sulphate transporter  52.24 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  49.09 
 
 		 509 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  46.34 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  46.41 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  45.67 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  44.29 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  45.82 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  44.4 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  43.09 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  44.4 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  43.6 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  44.6 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  44.6 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  44.44 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  44.4 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  44.14 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  44.75 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  44.2 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  44.4 
 
 		 483 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  44.4 
 
 		 483 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  45.51 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  45.51 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  43.8 
 
 		 492 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  43.18 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  43.18 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  43.28 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  44.74 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  43.52 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  43.78 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  44.2 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  43.41 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  40.82 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  43.03 
 
 		 499 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  46.15 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  45.95 
 
 		 501 aa  362  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  42.19 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  42.86 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  42.86 
 
 		 496 aa  359  9e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  41.73 
 
 		 495 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  40 
 
 		 506 aa  355  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  45.55 
 
 		 492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  41.26 
 
 		 495 aa  353  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2102  sulphate transporter  42.64 
 
 		 495 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  42.39 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4611  sulphate transporter  43.6 
 
 		 493 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  41.28 
 
 		 497 aa  350  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3083  sulphate transporter  43.7 
 
 		 498 aa  350  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0982983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  40.98 
 
 		 496 aa  349  8e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  40.65 
 
 		 495 aa  349  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0431  sulphate transporter  41.72 
 
 		 494 aa  348  9e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0215713  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  39.24 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>