More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03661 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  67.37 
 
 
519 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  67.18 
 
 
509 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  68.85 
 
 
519 aa  697    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  68.18 
 
 
504 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  67.5 
 
 
520 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  66.99 
 
 
521 aa  679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  69.04 
 
 
519 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  70 
 
 
519 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  100 
 
 
521 aa  1044    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  70 
 
 
519 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000026912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  72.88 
 
 
521 aa  770    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  70.19 
 
 
519 aa  750    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  70 
 
 
519 aa  714    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  71.73 
 
 
518 aa  736    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  86.73 
 
 
521 aa  900    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2406  sulphate transporter  69.81 
 
 
525 aa  699    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181309  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2476  sulphate transporter  70 
 
 
525 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  67.37 
 
 
515 aa  683    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  64.84 
 
 
540 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  70 
 
 
519 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2568  sulphate transporter  70.19 
 
 
519 aa  703    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.612653  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  68.65 
 
 
518 aa  692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2635  sulphate transporter  68.65 
 
 
518 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000740978  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  58.57 
 
 
512 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  58.48 
 
 
511 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  55.11 
 
 
512 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  57.33 
 
 
541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  53.67 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  58.99 
 
 
512 aa  568  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2067  sulfate transporter  61.1 
 
 
534 aa  567  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701494  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  55.27 
 
 
504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  56.48 
 
 
515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  52.5 
 
 
511 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  57.77 
 
 
509 aa  561  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  55.28 
 
 
539 aa  561  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  58.06 
 
 
540 aa  558  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  54.31 
 
 
539 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  54.49 
 
 
539 aa  549  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  49.71 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  53.13 
 
 
525 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2321  sulphate transporter  59.69 
 
 
536 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  53.66 
 
 
481 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  51.64 
 
 
495 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  53.25 
 
 
481 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  47.88 
 
 
509 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1752  sulphate transporter  52.83 
 
 
480 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.516323  normal  0.0556997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  53.25 
 
 
481 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  52.23 
 
 
480 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  52.02 
 
 
480 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41950  sulphate transporter  53.86 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  49.3 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  48.28 
 
 
483 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  45.6 
 
 
492 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  45.81 
 
 
483 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  46.44 
 
 
483 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  45.73 
 
 
487 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  46.23 
 
 
483 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  44.99 
 
 
483 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  46.44 
 
 
483 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  46.25 
 
 
483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  46.23 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  44.08 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  46.23 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  45.81 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  46.94 
 
 
499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  45.25 
 
 
483 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  44.29 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  44.44 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  44.72 
 
 
502 aa  398  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  45.01 
 
 
496 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  46.03 
 
 
496 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  45.42 
 
 
496 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  43.23 
 
 
500 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  43.78 
 
 
499 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  44.81 
 
 
496 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  43.23 
 
 
492 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  43.23 
 
 
492 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  43.41 
 
 
514 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  42.97 
 
 
499 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  42.74 
 
 
494 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  43.58 
 
 
502 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  42.26 
 
 
493 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  41.05 
 
 
495 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  41.45 
 
 
495 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  41.18 
 
 
495 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  42.13 
 
 
506 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  41.97 
 
 
496 aa  363  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  44.92 
 
 
492 aa  362  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  41.57 
 
 
499 aa  361  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0945  sulfate transporter  41.78 
 
 
495 aa  360  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0235468  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  41.43 
 
 
496 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2784  sulphate transporter  42.83 
 
 
494 aa  359  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.423283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  41.16 
 
 
495 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  44.51 
 
 
501 aa  359  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  41.12 
 
 
496 aa  358  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  44.31 
 
 
501 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  42.91 
 
 
497 aa  356  6.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4611  sulphate transporter  42.4 
 
 
493 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3083  sulphate transporter  43.55 
 
 
498 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0982983  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4351  sulphate transporter  40.77 
 
 
496 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>