More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0671 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  70 
 
 
512 aa  755    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  63.73 
 
 
509 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  71.76 
 
 
511 aa  773    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  73.48 
 
 
509 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  72.6 
 
 
504 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  100 
 
 
510 aa  1016    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  60.88 
 
 
512 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  57.49 
 
 
512 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  54.06 
 
 
518 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  52.87 
 
 
509 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  51.88 
 
 
519 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  53.29 
 
 
519 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  52.08 
 
 
519 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  51.64 
 
 
520 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  52.93 
 
 
521 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  51.31 
 
 
540 aa  538  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  49.71 
 
 
521 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  52.3 
 
 
518 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  50 
 
 
521 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  50 
 
 
519 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  52.08 
 
 
519 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  50.51 
 
 
511 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  52.28 
 
 
519 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000026912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  52.28 
 
 
519 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  52.08 
 
 
519 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2635  sulphate transporter  52.38 
 
 
518 aa  521  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000740978  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  49.42 
 
 
515 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  50.7 
 
 
504 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2406  sulphate transporter  51.92 
 
 
525 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181309  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2568  sulphate transporter  52.33 
 
 
519 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.612653  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  49.12 
 
 
521 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2476  sulphate transporter  52.49 
 
 
525 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  51.6 
 
 
515 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  50 
 
 
540 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2067  sulfate transporter  51.31 
 
 
534 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701494  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2321  sulphate transporter  50.81 
 
 
536 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  49.26 
 
 
480 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  47.57 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  47.57 
 
 
509 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  49.38 
 
 
481 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  46.21 
 
 
539 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  49.47 
 
 
480 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  49.17 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  46.21 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  47.79 
 
 
495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  46.21 
 
 
539 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1752  sulphate transporter  49.05 
 
 
480 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.516323  normal  0.0556997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  49.38 
 
 
481 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  44.04 
 
 
525 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41950  sulphate transporter  49.26 
 
 
481 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  44.95 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  39.29 
 
 
483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  38.4 
 
 
483 aa  358  9e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  37.35 
 
 
487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  37.97 
 
 
483 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  37.7 
 
 
492 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  38.19 
 
 
483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  38.61 
 
 
483 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  39.19 
 
 
496 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  38.4 
 
 
483 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  37.76 
 
 
484 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  38.19 
 
 
483 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  36.69 
 
 
500 aa  350  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  38.33 
 
 
496 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  37.97 
 
 
483 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  37.97 
 
 
483 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  38.61 
 
 
499 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  37.76 
 
 
483 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  37.42 
 
 
502 aa  347  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  38.91 
 
 
527 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  38.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  38.33 
 
 
496 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  38.72 
 
 
499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 
496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  38.36 
 
 
496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4351  sulphate transporter  39.61 
 
 
496 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  37.31 
 
 
496 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  36.89 
 
 
492 aa  339  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  36.89 
 
 
492 aa  339  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  38.06 
 
 
495 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0902  sulphate transporter  38.43 
 
 
496 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  37.58 
 
 
483 aa  334  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0896  sulphate transporter  38.43 
 
 
496 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0913  sulphate transporter  38.43 
 
 
496 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846691  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  38.06 
 
 
495 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  0.000000000000146923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  37.29 
 
 
495 aa  333  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  37.69 
 
 
494 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  37.32 
 
 
502 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  37.97 
 
 
506 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  35.4 
 
 
496 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  36.93 
 
 
493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0374  sulphate transporter  38.38 
 
 
498 aa  329  8e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  36.92 
 
 
499 aa  329  9e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  36.42 
 
 
499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  36.4 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0555  sulphate transporter  35.99 
 
 
497 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  35.61 
 
 
495 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2784  sulphate transporter  37.79 
 
 
494 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.423283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  36.92 
 
 
501 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21570  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  37.81 
 
 
505 aa  317  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>