More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1261 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  100 
 
 
515 aa  1030    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  60.27 
 
 
519 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  61.87 
 
 
509 aa  620  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  60.16 
 
 
540 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  57.94 
 
 
511 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  59.81 
 
 
518 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  60.27 
 
 
519 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000026912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  60.08 
 
 
519 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  60.08 
 
 
519 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  60.08 
 
 
519 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  60.46 
 
 
519 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  60.5 
 
 
521 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  59.35 
 
 
519 aa  591  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  59.13 
 
 
512 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  59.81 
 
 
519 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  60.47 
 
 
504 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  58.61 
 
 
515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  55.73 
 
 
521 aa  581  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2406  sulphate transporter  59.12 
 
 
525 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181309  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2568  sulphate transporter  59.3 
 
 
519 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.612653  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  59.03 
 
 
518 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  56.48 
 
 
521 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2635  sulphate transporter  59.03 
 
 
518 aa  568  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000740978  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2476  sulphate transporter  58.93 
 
 
525 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  57 
 
 
521 aa  561  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  52.73 
 
 
512 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  55.96 
 
 
520 aa  551  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  51.56 
 
 
511 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  51.86 
 
 
509 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2067  sulfate transporter  57.68 
 
 
534 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701494  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  56.13 
 
 
540 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  55.27 
 
 
512 aa  528  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  54.34 
 
 
541 aa  528  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  50.6 
 
 
504 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  53.14 
 
 
509 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  51.6 
 
 
510 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  53.85 
 
 
495 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  54.53 
 
 
480 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  52.5 
 
 
539 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  53.91 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1752  sulphate transporter  54.32 
 
 
480 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.516323  normal  0.0556997 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  51.92 
 
 
539 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  54.05 
 
 
481 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  53.85 
 
 
481 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  52.31 
 
 
539 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  54.43 
 
 
481 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2321  sulphate transporter  57.34 
 
 
536 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  50.67 
 
 
525 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41950  sulphate transporter  54.43 
 
 
481 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  48.01 
 
 
509 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  48.47 
 
 
509 aa  432  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  44.47 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  47.19 
 
 
496 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  43.26 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  46.82 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  46.07 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  44.1 
 
 
496 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  44.83 
 
 
487 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  44 
 
 
483 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  43.23 
 
 
483 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  44.12 
 
 
492 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  45.66 
 
 
484 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  45.36 
 
 
502 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  44.24 
 
 
496 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  44.44 
 
 
483 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  43.26 
 
 
483 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  43.26 
 
 
483 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  46.32 
 
 
496 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  42.86 
 
 
483 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  42.86 
 
 
483 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  42.86 
 
 
483 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  44.61 
 
 
492 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  44.61 
 
 
492 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  44.72 
 
 
494 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  44.15 
 
 
500 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  43.69 
 
 
495 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  43.41 
 
 
496 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  42.83 
 
 
495 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  43.2 
 
 
496 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  42.94 
 
 
495 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  0.000000000000146923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  41.94 
 
 
499 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2784  sulphate transporter  43.42 
 
 
494 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.423283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  44.81 
 
 
514 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  43.53 
 
 
499 aa  369  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  45.51 
 
 
501 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  42.95 
 
 
493 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  45.31 
 
 
501 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  42.86 
 
 
496 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  40.36 
 
 
495 aa  364  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  42.92 
 
 
499 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  43.13 
 
 
495 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  40.88 
 
 
506 aa  359  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3144  sulphate transporter  42.89 
 
 
501 aa  359  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  45.06 
 
 
497 aa  358  9e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0945  sulfate transporter  41 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0235468  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  41.51 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  44.28 
 
 
502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  41.48 
 
 
483 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  41.88 
 
 
527 aa  356  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  41.67 
 
 
499 aa  356  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>