17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0797 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0797  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  878    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.853648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3324  hypothetical protein  61.44 
 
 
409 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0188  hypothetical protein  41.56 
 
 
363 aa  309  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
780 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3554  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 
340 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
1073 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5205  TPR repeat-containing protein  44.35 
 
 
361 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000197497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0903  hypothetical protein  32.19 
 
 
357 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1084  hypothetical protein  36.55 
 
 
390 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656403  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2091  hypothetical protein  30.85 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.280136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1336  hypothetical protein  37.01 
 
 
360 aa  183  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0456128  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1510  hypothetical protein  30.32 
 
 
387 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183129  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0733  hypothetical protein  29.8 
 
 
496 aa  180  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1755  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
693 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000187342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0317  hypothetical protein  30.96 
 
 
361 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1935  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.86 
 
 
314 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0226  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.25 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>