15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0188 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  758    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0797  hypothetical protein  41.56 
 
 		 421 aa  309  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.853648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3324  hypothetical protein  53.17 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5205  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000197497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  41.19 
 
 		 780 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 1073 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3554  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0903  hypothetical protein  36.28 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2091  hypothetical protein  38.04 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.280136  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0733  hypothetical protein  34.9 
 
 		 496 aa  206  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1510  hypothetical protein  35.95 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1336  hypothetical protein  35.55 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0456128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1755  GCN5-related N-acetyltransferase  35.31 
 
 		 693 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000187342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1084  hypothetical protein  31.48 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656403  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0317  hypothetical protein  33.62 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>