16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1336 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1336  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0456128  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2091  hypothetical protein  64.93 
 
 
348 aa  478  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.280136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1755  GCN5-related N-acetyltransferase  56.65 
 
 
693 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000187342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0317  hypothetical protein  55.14 
 
 
361 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1510  hypothetical protein  46.33 
 
 
387 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183129  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0733  hypothetical protein  48.28 
 
 
496 aa  348  7e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5205  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 
361 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000197497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  39.82 
 
 
780 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0903  hypothetical protein  38.14 
 
 
357 aa  252  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21627  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
1073 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3554  TPR repeat-containing protein  41.85 
 
 
340 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1084  hypothetical protein  36.12 
 
 
390 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656403  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0188  hypothetical protein  35.55 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0797  hypothetical protein  37.01 
 
 
421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.853648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3324  hypothetical protein  37.6 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237528 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14931  hypothetical protein  26.67 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0381565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>