18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1755 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1755  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
693 aa  1442    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000187342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0317  hypothetical protein  61.21 
 
 
361 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2091  hypothetical protein  59.65 
 
 
348 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.280136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1336  hypothetical protein  56.65 
 
 
360 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0456128  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0733  hypothetical protein  44.47 
 
 
496 aa  411  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1510  hypothetical protein  50.58 
 
 
387 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183129  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5205  TPR repeat-containing protein  41.34 
 
 
361 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000197497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
1073 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  38.68 
 
 
780 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3554  TPR repeat-containing protein  40.41 
 
 
340 aa  237  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0903  hypothetical protein  36.08 
 
 
357 aa  228  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1084  hypothetical protein  37.32 
 
 
390 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656403  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0188  hypothetical protein  35.31 
 
 
363 aa  197  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3324  hypothetical protein  40 
 
 
409 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0797  hypothetical protein  30.63 
 
 
421 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.853648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0901  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 
295 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1867  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
293 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0884  hypothetical protein  26.51 
 
 
339 aa  93.6  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>