16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5205 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5205  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
361 aa  752    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000197497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  68.93 
 
 
780 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  59.38 
 
 
1073 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3554  TPR repeat-containing protein  49.85 
 
 
340 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0188  hypothetical protein  41.79 
 
 
363 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0903  hypothetical protein  42.73 
 
 
357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21627  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1336  hypothetical protein  41.79 
 
 
360 aa  278  7e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0456128  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1755  GCN5-related N-acetyltransferase  41.34 
 
 
693 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000187342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0733  hypothetical protein  42.98 
 
 
496 aa  269  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1510  hypothetical protein  44.71 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183129  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0317  hypothetical protein  40.5 
 
 
361 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2091  hypothetical protein  40.47 
 
 
348 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.280136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3324  hypothetical protein  34.02 
 
 
409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0797  hypothetical protein  44.35 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.853648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1084  hypothetical protein  38.8 
 
 
390 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656403  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14931  hypothetical protein  23.78 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0381565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>