16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3554 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3554  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 340 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5205  TPR repeat-containing protein  49.85 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000197497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  47.47 
 
 		 1073 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  44.86 
 
 		 780 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0903  hypothetical protein  41.3 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0188  hypothetical protein  38.92 
 
 		 363 aa  255  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1084  hypothetical protein  42.27 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656403  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0797  hypothetical protein  33.25 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.853648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3324  hypothetical protein  31.91 
 
 		 409 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1336  hypothetical protein  41.85 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0456128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0733  hypothetical protein  40.18 
 
 		 496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2091  hypothetical protein  42.47 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.280136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1755  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 		 693 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000187342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1510  hypothetical protein  42.54 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0317  hypothetical protein  37.27 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14931  hypothetical protein  27.46 
 
 		 403 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0381565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>