20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2365 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2365  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  834    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0153021  normal  0.414563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  52.22 
 
 
377 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5952  hypothetical protein  40.75 
 
 
400 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  38.69 
 
 
371 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  34.95 
 
 
371 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  27.15 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  23.62 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  24.16 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  25.34 
 
 
463 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  23.44 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  36 
 
 
418 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  23.28 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  26.13 
 
 
380 aa  50.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  22.46 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  22.83 
 
 
413 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  19.55 
 
 
443 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  26.67 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  25.61 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  30.77 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  21.73 
 
 
442 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>