28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2354 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  99.66 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  99.66 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  99.33 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  56.8 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  55.56 
 
 		 304 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  51.5 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  51.8 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  35.55 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0784  hypothetical protein  58.82 
 
 		 136 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3797  hypothetical protein  58.1 
 
 		 138 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  30.49 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3205  hypothetical protein  50.48 
 
 		 134 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  27.87 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  34.64 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  25.19 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  30.36 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  32.33 
 
 		 216 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  28.26 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  26.28 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  40.51 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  25.6 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  34.78 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  26.39 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  41.27 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  30.77 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  26.82 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  44.23 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>