70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1937 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  63.73 
 
 		 193 aa  262  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  48.06 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  45.85 
 
 		 217 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  45.85 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  45.77 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  43.9 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  46.88 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  47.55 
 
 		 211 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  45.81 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  43.63 
 
 		 211 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  46.08 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  41.88 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  41.58 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  41.58 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  41.05 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  40.53 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  40.53 
 
 		 273 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  41.12 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  38.24 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  35.58 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  43.86 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  35.64 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  36.36 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  34.12 
 
 		 217 aa  95.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  34.22 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  34.22 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  34.22 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  34.22 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  39.86 
 
 		 226 aa  84.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  37.6 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  34.57 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  35.1 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  53.62 
 
 		 119 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  52.17 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  52.17 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  28.72 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  28.72 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  28.73 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  41.98 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  29.94 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  38.89 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  33.08 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  31.69 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  33.08 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  30.83 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  29.41 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  27.36 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  24.87 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  27.81 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  25.67 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1872  phage baseplate assembly protein V  25.95 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  37.5 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2522  phage baseplate assembly protein V  30.48 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  30.56 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  26.71 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  36.61 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  41.56 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  25.54 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  30.39 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  26.7 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  30.19 
 
 		 545 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  30.19 
 
 		 545 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 916 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  32.39 
 
 		 874 aa  41.6  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  32.39 
 
 		 922 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  28.32 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58454  predicted protein  32.86 
 
 		 809 aa  41.2  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  26.92 
 
 		 565 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>