54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2612 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  244  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  244  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  62.96 
 
 
108 aa  148  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  30.93 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  23.76 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  27 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  27 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  27 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  27 
 
 
104 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  27 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  27.84 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  27 
 
 
104 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  28.42 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  28.72 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  27.27 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  25 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  22.33 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  29.03 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  30.39 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  31.11 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  30.56 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  34.29 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  26.67 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  27.63 
 
 
122 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
106 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  28.89 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  31.03 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  25.22 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  27.03 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  24.1 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  26.83 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  29.11 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  27.16 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  25.3 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  27.59 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  25.93 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  30.69 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  30.49 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  25.37 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1268  glutaredoxin 2  25.3 
 
 
95 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  28.89 
 
 
144 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  28.12 
 
 
189 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  30.88 
 
 
145 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  29.73 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  26.83 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  24.1 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  27.03 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  26.92 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  27.16 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  33.33 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  31.88 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  28.77 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  21.36 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>